אנחנו עובדים על שחזור אפליקציית Unionpedia ב-Google Play Store
יוֹצֵאנִכנָס
🌟פישטנו את העיצוב שלנו לניווט טוב יותר!
Instagram Facebook X LinkedIn
יוניונפדיה שלך עם הלוגו והדומיין שלך, החל מ-9.99 דולר לחודש
צור את יוניונפדיה שלי

ENCODE

מַדָד ENCODE

ENCODE (ראשי תיבות של: "Encyclopedia of DNA Elements" - אנציקלופדיה של מרכיבי DNA) הוא מיזם מחקר ציבורי שהושק על ידי המכון הלאומי לחקר הגנום האנושי בספטמבר 2003. [1]

תוכן עניינים

  1. 49 יחסים: Caenorhabditis elegans, ChIP-seq, DNA, DNA לא-מקודד, DNA זבל, GenBank, Nature, RNA, RNA-seq, SNP, מאמר סקירה, מעצם, משאב ציבורי, מיזם אלף הגנומים, אנוטציית DNA, אפיגנטיקה, אקסון (גנטיקה), אקסום, ארצות הברית, אזור מקודד, אבולוציה, אורגניזם מודל, סגוליות, פסאודוגן, פרויקט גנום האדם, פרימטים, קדם, קונסורציום, קוד היסטונים, ריצוף DNA, שעתוק (ביולוגיה), שגיאה מסוג I, זוג בסיסים, חלבון, בקרת שעתוק, גן (ביולוגיה), גנומיקה, גנומיקה השוואתית, גנום, גורם שעתוק, דרוזופילה, המכון הלאומי לחקר הגנום האנושי, המכונים הלאומיים לבריאות, הדפדפן הגנומי של אוניברסיטת קליפורניה, כרומטין, כריית מידע, יונקים, 2003, 2014.

Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans (או בקיצור C. elegans) היא מין של נמטודה (תולעת עגולה) באורך של כ-1 מ"מ, אשר חיה באדמה בטמפרטורות פושרות.

לִרְאוֹת ENCODE וCaenorhabditis elegans

ChIP-seq

תהליך ChIP-seq ChIP-seq או ChIP-sequencing היא שיטה המשלבת מיצוי נוגדני של כרומטין (ChIP) יחד עם ריצוף מסיבי של DNA כדי לחקור אינטראקציות של חלבונים עם DNA.

לִרְאוֹת ENCODE וChIP-seq

DNA

מודל DNA אנושי DNA (ראשי תיבות באנגלית של Deoxyribonucleic Acid, חומצה דאוקסיריבונוקלאית; בתעתוק לעברית: דנ"א או די־אן־איי) היא מולקולת ענק של חומצת גרעין הבנויה כשרשרת נוקלאוטידים.

לִרְאוֹת ENCODE וDNA

DNA לא-מקודד

DNA לא-מקודד הוא חלק מה-DNA הנמצא ביצורים, אשר אינו מתורגם לחלבונים.

לִרְאוֹת ENCODE וDNA לא-מקודד

DNA זבל

DNA זבל (באנגלית: Junk DNA) הוא מונח פופולרי לחלק מן הגנום של יצורים איקריוטיים, שאין לו תפקוד מועיל לאורגניזם, ונראה כי הוא נוצר וממשיך לעבור שכפול כתוצאה מתאונות אקראיות.

לִרְאוֹת ENCODE וDNA זבל

GenBank

תקליטור המכיל את גרסה 100 של Genbank GenBank (בעברית: בנק הגנים) הוא מסד הנתונים עבור רצפים האוסף בגישה חופשית של כל רצפי הנוקלאוטידים הזמינים לציבור והחלבונים המתורגמים מהם.

לִרְאוֹת ENCODE וGenBank

Nature

Nature הוא כתב עת מדעי שבועי רב-תחומי בריטי, שפורסם לראשונה ב-4 בנובמבר 1869.

לִרְאוֹת ENCODE וNature

RNA

הסליל החד גדילי של ה-mRNA המכונה גם RNA שליח. סגול - אטום פחמן, לבן - אטום מימן, אדום - חמצן, צהוב - חנקן מבנה מולקולת ה-RNA. קבוצות הזרחה באדום-כתום, הריבוז בירוק, והבסיסים החנקנים בירוק-כחול צילום של RNA שהופק מתאי DA3 (סרטן בלוטת החלב של עכברים).

לִרְאוֹת ENCODE וRNA

RNA-seq

#הפניה ריצוף RNA.

לִרְאוֹת ENCODE וRNA-seq

SNP

דוגמה ל-SNP, מולקולת דנ"א 1 שונה ממולקולת דנ"א 2 במיקום המסומן (פולימורפיזם C/T) SNP (Single Nucleotide Polymorphism, רב צורניות של נוקלאוטיד בודד, מכונה גם סניפּ) הוא וריאציה של רצף הדנ"א המתרחשת כאשר נוקלאוטיד יחיד (A, C, G או T) בגנום נבדל בין פרטים במינים ביולוגיים או בין כרומוזומים הומולוגיים באדם.

לִרְאוֹת ENCODE וSNP

מאמר סקירה

מאמר סקירה (באנגלית: Review article) או סקירת ספרות (באנגלית: Literature review) הוא מאמר המסכם מאמרים רבים קודמים בנושא כלשהו.

לִרְאוֹת ENCODE ומאמר סקירה

מעצם

מַעֲצֵם (באנגלית: Enhancer) הוא מקטע DNA קצר, המשמש להגברת תיעתוק של גנים באופן ספציפי לסוג התא ולזמן ההתפתחותי.

לִרְאוֹת ENCODE ומעצם

משאב ציבורי

#הפניה נחלת הכלל.

לִרְאוֹת ENCODE ומשאב ציבורי

מיזם אלף הגנומים

מיזם אלף הגנומים (אנגלית: The 1000 Genomes Project) הוא מאמץ מחקרי בינלאומי לייסד קטלוג של הגנום האנושי.

לִרְאוֹת ENCODE ומיזם אלף הגנומים

אנוטציית DNA

אנוטציית DNA (או אנוטציית גנום) הוא תהליך של זיהוי אזורים מקודדים בגנום וקביעת התפקידים של כל גן.

לִרְאוֹת ENCODE ואנוטציית DNA

אפיגנטיקה

אפיגנטיקה (באנגלית: Epigenetics) הוא התחום בביולוגיה העוסק בשינויים בתפקוד הגנים שאינם כרוכים בשינוי רצף ה-DNA עצמו.

לִרְאוֹת ENCODE ואפיגנטיקה

אקסון (גנטיקה)

תהליך הוצאת האינטרונים מה-pre-mRNA (הגדיל העליון) וחיבור האקסונים האחד לשני נקרא שחבור בגנטיקה, אקסון (באנגלית: Exon) הוא רצף נוקלאוטידים ב-DNA המהווה חלק מה-mRNA הבוגר לאחר ששאר חלקי הגן אשר קרויים אינטרונים מוצאים החוצה בתהליך של splicing המושג נטבע על ידי וולטר גילברט ב-1978 והוא נגזר מהמילה Expressed באנגלית, "מבוטא".

לִרְאוֹת ENCODE ואקסון (גנטיקה)

אקסום

האסטלה של רומא ("האובליסק") בפיאצה די פורטה קאפנה לפני השבתה לאתיופיה מראה במחצבת האסטלות סמוך לעיר מראה כללי של כנסיית גבירתנו מרים מציון החדשה ומגדל הפעמונים שלה אַקְסוּם (באמהרית: አክሱም, תעתיק מדויק: אכסום) היא עיר בצפון אתיופיה השוכנת במחוז תיגראי המרכזית שבתיגראי.

לִרְאוֹת ENCODE ואקסום

ארצות הברית

ארצות הברית של אמריקה (באנגלית: United States of America; בראשי תיבות: USA; בקיצור: United States; לעיתים מקוצר גם בראשי תיבות: US; בתרגום מילולי לעברית: "המדינות המאוחדות של אמריקה", המוכרת בשם המקוצר, ארצות הברית ובראשי תיבות ארה"ב) היא פדרציה ורפובליקה-חוקתית ומעצמת-על המורכבת מ-50 מדינות, ממחוז פדרלי אחד ו-5 טריטוריות.

לִרְאוֹת ENCODE וארצות הברית

אזור מקודד

ה-CDS הוא הרצף החופף לאזורים האדומים במולקולת ה-mRNA. אזור מקודד של גן, ידוע גם כרצף מקודד או בקיצור האנגלי – CDS (coding DNA sequence), הוא החלק מתוך רצף ה-DNA וה-RNA של הגן שבו נמצאים האקסונים, שבתוכן נמצא המידע הגנטי הדרוש ליצירת חלבון.

לִרְאוֹת ENCODE ואזור מקודד

אבולוציה

אבולוציה (באנגלית: Evolution) היא תאוריה מדעית המסבירה כיצד כל המינים התפתחו מאב קדמון משותף על ידי תהליכים של התאמה הדרגתית לסביבה ושינויים בסחף הגנטי.

לִרְאוֹת ENCODE ואבולוציה

אורגניזם מודל

החיידק ''E. coli'' גרעיני תירס בצורות וצבעים שונים פרחי התודרנית הלבנה התולעת ''C. elegans'' תסיסנית המחקר עכבר מצוי קביה אורגניזם מודל (באנגלית: Model organism) הוא יצור חי, אשר נחקר באופן אינטנסיבי בביולוגיה או בפסיכולוגיה.

לִרְאוֹת ENCODE ואורגניזם מודל

סגוליות

סגוליות סגוליות (גם ספציפיות. באנגלית: Specificity) היא מדד סטטיסטי ליעילותו של מסווג (כמו בדיקה רפואית או בדיקת בקרת איכות) בשלילת קיומו של מצב מסוים.

לִרְאוֹת ENCODE וסגוליות

פסאודוגן

פסאודוגן (באנגלית: Pseudogene) הוא מקטע DNA הדומה במקורו וברצפו לגן פעיל, אך ברב המקרים איבד את הפעילות.

לִרְאוֹת ENCODE ופסאודוגן

פרויקט גנום האדם

הלוגו של מיזם גנום האדם פרויקט גנום האדם (או פרויקט הגנום האנושי) היה מיזם מדעי בינלאומי שנועד לפענח את רצף זוגות הבסיסים המרכיבים את ה-DNA של האדם ושל חמישה אורגניזמי מודל, ולזהות ולמפות את כל הגנים בגנום האדם, מבחינה פיזקלית ופונקציונלית.

לִרְאוֹת ENCODE ופרויקט גנום האדם

פרימטים

פרימטים (שם מדעי: Primates; קופאים) היא סדרה במחלקת היונקים הכוללת למעלה מ-200 מיני קופים, קופיפים וקופי אדם.

לִרְאוֹת ENCODE ופרימטים

קדם

קַדָּם (באנגלית: Promoter; ובתעתיק לעברית המשמש בז'רגון המדעי: פְּרוֹמוֹטֶר) הוא אזור ב-DNA האחראי לבקרה של ביטוי גן הסמוך אליו.

לִרְאוֹת ENCODE וקדם

קונסורציום

קונסורציום (באנגלית: Consortium) או מַאֲגָד הוא התאגדות של לפחות שני אינדיבידואליים, חברות, ארגונים או ממשלות (או כל שילוב של גופים אלה) במטרה להשתתף בפעילות משותפת או לאחד את משאביהם להשגת מטרה משותפת.

לִרְאוֹת ENCODE וקונסורציום

קוד היסטונים

קוד היסטונים (באנגלית: Histone Code) היא היפותזה שהשעתוק של אינפורמציה גנטית המקודדת בדנ"א, מווסת בחלקו על ידי מודיפיקציות כימיות של חלבוני ההיסטון, בעיקר על הקצה החופשי שלהם.

לִרְאוֹת ENCODE וקוד היסטונים

ריצוף DNA

חלק מג'ל עם מקטעי DNA מסומנים דוגמאות לשימוש ב־4 צבעים פלואורסצנטיים לפי שיטת סנגר: מימין, דוגמה לשימוש בצבען מתייג על קצה הדידאוקסינוקליאוטיד. משמאל, הדמיה של שימוש בתיוג על התחל.

לִרְאוֹת ENCODE וריצוף DNA

שעתוק (ביולוגיה)

הדוֹגמה המרכזית של הביולוגיה המולקולרית" שעתוק (על פי המינוח התקני: תעתוק; באנגלית: Transcription, לעיתים בתעתיק לעברית: טרנסקריפציה) הוא תהליך בביולוגיה של התא שבו מולקולת RNA מיוצרת לפי תבנית של מולקולת DNA.

לִרְאוֹת ENCODE ושעתוק (ביולוגיה)

שגיאה מסוג I

#הפניה שגיאות מסוג I ו-II.

לִרְאוֹת ENCODE ושגיאה מסוג I

זוג בסיסים

זוג בסיסים (אנגלית: Base pair, ראשי תיבות: bp) הוא יחידת מידה המשמשת בביולוגיה מולקולרית למדידת אורך של DNA.

לִרְאוֹת ENCODE וזוג בסיסים

חלבון

מבנה רביעוני של חלבון קטלאז, המתפקד כאנזים חלבון (בלועזית: פרוטאין, מיוונית - πρώτειος, פְּרוֹטַאִיוֹס - "ראשוני") הוא תרכובת אורגנית גדולה ומורכבת יחסית, הבנויה משרשרת מקופלת של חומצות אמיניות הקשורות ביניהן בקשרים פפטידיים בין הקבוצה הקרבוקסילית של החומצה האמינית לקבוצה האמינית של החומצה השנייה.

לִרְאוֹת ENCODE וחלבון

בקרת שעתוק

בביולוגיה מולקולרית ובגנטיקה, בקרת שעתוק כולל את מגוון הדרכים שבו תא מבקר את תהליך המרת ה-DNA ל-RNA (שעתוק), ובכך שותף בתהליך בקרת הגנים.

לִרְאוֹת ENCODE ובקרת שעתוק

גן (ביולוגיה)

איור של הגנום האנושי, מהגנום לכרומוזום, ומכרומוזום לגנים בביולוגיה, גֵּן הוא יחידת מידע המועברת מאורגניזם לצאצאיו באמצעות החומר התורשתי (לרוב DNA ולעיתים RNA).

לִרְאוֹת ENCODE וגן (ביולוגיה)

גנומיקה

גנומיקה היא תחום בגנטיקה העוסק במכלול החומר התורשתי – הגנום – של יצורים חיים.

לִרְאוֹת ENCODE וגנומיקה

גנומיקה השוואתית

גנומיקה השוואתית (באנגלית: Comparative genomics) הוא תחום משנה בגנומיקה, העוסק בניתוח הרצף והמיקום הכרומוזומי של גנים בעלי אותו תפקיד ומידע גנטי בין יצורים שונים (גנים אורתולוגיים), התחקות אחר ההבדלים ביניהם, הארגון שלהם בגנום והבנת מקורם.

לִרְאוֹת ENCODE וגנומיקה השוואתית

גנום

מסמלי פרויקט גנום האדם בביולוגיה, גֵּנוֹם (בעברית: מִכְלוֹל הַגֵּנִים) הוא השם הניתן לרוב לכלל המידע התורשתי באורגניזם המקודד ב־DNA (ובחלק מהנגיפים ב־RNA).

לִרְאוֹת ENCODE וגנום

גורם שעתוק

מודל בסיסי לפעילותו של גורם שעתוק בביולוגיה מולקולרית, גורם שעתוק (באנגלית: Transcription factor) הוא חלבון הנקשר לרצף DNA ספציפי, הנמצא לפני החלק המקודד של הגן, ובכך משפיע על שעתוק הגן ל-mRNA.

לִרְאוֹת ENCODE וגורם שעתוק

דרוזופילה

תסיסנית (שם מדעי: Drosophila) הידועה גם כדרוזופילה או, בכינויה השגור והמטעה, זבוב הפירות, היא סוג של זבוב במשפחת התסיסניתיים.

לִרְאוֹת ENCODE ודרוזופילה

המכון הלאומי לחקר הגנום האנושי

סמליל המכון הלאומי לחקר גנום האדם המכון הלאומי לחקר גנום האדם (באנגלית: National Human Genome Research Institute, בראשי תיבות: NHGRI), עוסק בחקר גנום האדם, ונמנה עם המכונים הלאומיים לבריאות של ארצות הברית.

לִרְאוֹת ENCODE והמכון הלאומי לחקר הגנום האנושי

המכונים הלאומיים לבריאות

לא ממוסגר המכונים הלאומיים לבריאות (באנגלית: The National Institutes of Health; בראשי תיבות: NIH) הם סוכנות של מחלקת הבריאות ושירותי האנוש בממשלת ארצות הברית והסוכנות הממשלתית העיקרית האחראית למחקר ביו-רפואי.

לִרְאוֹת ENCODE והמכונים הלאומיים לבריאות

הדפדפן הגנומי של אוניברסיטת קליפורניה

#הפניה הדפדפן הגנומי של אוניברסיטת קליפורניה בסנטה קרוז.

לִרְאוֹת ENCODE והדפדפן הגנומי של אוניברסיטת קליפורניה

כרומטין

רמות האריזה השונות של ה-DNA כרומטין (באנגלית: Chromatin) הוא כינויו של ה-DNA יחד עם החלבונים הנלווים אליו.

לִרְאוֹת ENCODE וכרומטין

כריית מידע

כריית מידע או כריית נתונים (באנגלית: Data mining) היא הפעלת אלגוריתם או תוכנית מחשב לצורך גילוי מידע הטמון בבסיסי נתונים קיימים, והסקת מסקנות מהצלבתו.

לִרְאוֹת ENCODE וכריית מידע

יונקים

ברווזן, יונק מטיל ביצים מסדרת יונקי הביב (בשחייה) טקסט.

לִרְאוֹת ENCODE ויונקים

2003

ינואר.

לִרְאוֹת ENCODE ו2003

2014

למרות קור עז בתחילת השנה, 2014 הייתה שנה חמה במיוחד ועל פי פרסום NOAA באוקטובר, היו עשרת החודשים הראשונים החמים ביותר שתועדו אי פעם.

לִרְאוֹת ENCODE ו2014

אזכור

[1] https://he.wikipedia.org/wiki/ENCODE