סֵמֶל
יוניונפדיה
תִקשׁוֹרֶת
 Google Play כעת ב-
חָדָשׁ! הורד יוניונפדיה במכשיר אנדרואיד שלך!
חופשי
גישה מהירה יותר מאשר בדפדפן!
 

פורמט FASTQ

מַדָד פורמט FASTQ

פורמט FASTQ הוא פורמט בביואינפורמטיקה מבוסס טקסט אשר אוצר בתוכו לא רק את הרצף הביולוגי (כפי שעושה פורמט FASTA), אלא גם את ציון האיכות שלו כפי שנקלט במכשיר הריצוף. [1]

21 יחסים: +, ASCII, BWA, DNA, FASTA, HISAT, Phred quality score, SAM (פורמט קובץ), ~, אנליזת ריצוף - Bowtie, אילומינה, נוקלאוטיד, עימוד רצפים, פורמט FASTA, קרן ולקם, רצף ייחוס, ריצוף DNA, טקסט, ביואינפורמטיקה, דה פקטו, כרוכית.

+

#הפניה פלוס ומינוס.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ו+ · ראה עוד »

ASCII

מרווח, שהסימן הגרפי שלו הוא מקום ריק. בפינה הימנית התחתונה יש מקום לתו שאין לו סימן גרפי מקובל. מקום זה מופיע בתמונה רק כדי לאפשר הצגה תמציתית של התווים האחרים. ASCII (ראשי תיבות של: American Standard Code for Information Interchange) הוא קוד לייצוגם של תווים (ספרות, אותיות האלפבית, סימני פיסוק ועוד) בזיכרון מחשב ובקובצי מחשב.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וASCII · ראה עוד »

BWA

BWA היא תוכנה המשמשת לעימוד רצפים (alignment) כנגד גנום ייחוס גדול, כמו הגנום האנושי.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וBWA · ראה עוד »

DNA

מודל DNA אנושי DNA (ראשי תיבות באנגלית של Deoxyribonucleic Acid, חומצה דאוקסיריבונוקלאית; בתעתוק לעברית: דנ"א או די־אן־איי) היא מולקולת ענק של חומצת גרעין הבנויה כשרשרת נוקלאוטידים.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וDNA · ראה עוד »

FASTA

#הפניה פורמט FASTA.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וFASTA · ראה עוד »

HISAT

HISAT (מאנגלית: hierarchical indexing for spliced alignment of transcripts - אינדקס היררכי להתאמת תעתיקים שעברו שחבור) היא מערכת יעילה להתאמת קריאות מניסוי RNA-seq.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וHISAT · ראה עוד »

Phred quality score

ציון Phred (פרד) להערכת איכות הוא מדד איכותי לזיהוי הבסיסים (נוקליאוטידים) שמוצגים כפלט בתהליך ריצוף DNA.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וPhred quality score · ראה עוד »

SAM (פורמט קובץ)

מפת עימוד רצפים (SAM) היא פורמט מבוסס טקסט במקור לאחסון רצפים ביולוגיים אשר עוברים עימוד לרצף ייחוס שפותח על ידי הנג לי ובוב הנדסאקר.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וSAM (פורמט קובץ) · ראה עוד »

~

#הפניהטילדה.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ו~ · ראה עוד »

אנליזת ריצוף - Bowtie

Bowtie היא חבילת תוכנה נפוצה עבור עימוד רצפים ואנליזת ריצוף בביולוגיה חישובית.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ואנליזת ריצוף - Bowtie · ראה עוד »

אילומינה

אילומינה (באנגלית: Illumina) היא חברה אמריקאית שהוקמה באפריל 1998 המפתחת, מייצרת ומשווקת מערכות משולבות לניתוח שונות גנטית ותפקוד ביולוגי.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ואילומינה · ראה עוד »

נוקלאוטיד

האותיות המשמשות בביולוגיה לציון מקוצר של הנוקלאוטידים, לפי הבסיסים החנקניים המצויים בהם. חלק מאותיות משמשות לציון מספר נוקלאוטידים בעלי תכונה משותפת. העמודה השמאלית מראה את מקורן של האותיות, דבר העוזר בשינונן נוּקְלֵאוֹטִידִים (באנגלית: Nucleotide) הם קבוצה של תרכובות אורגניות.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ונוקלאוטיד · ראה עוד »

עימוד רצפים

בביואינפורמטיקה, עימוד רצפים היא שיטה לסידור המידע על אודות רצפי DNA,RNA או חלבונים, בצורה כזו שיהיה ניתן לזהות אזורים דומים, אשר ייתכן כי הם תוצאה של קשרים פונקציונלים, מבניים או אבולוציוניים.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ועימוד רצפים · ראה עוד »

פורמט FASTA

פורמט FASTA הוא מונח בביואינפורמטיקה המתאר את צורת הכתיבה המוסכמת לייצוג של רצף הנוקלאוטידים בחומצת גרעין או את רצף חומצות האמינו בחלבון.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ופורמט FASTA · ראה עוד »

קרן ולקם

קרן ולקם (באנגלית: The Wellcome Trust) היא קרן נדבנות השוכנת בלונדון ופועלת בבריטניה ומחוצה לה.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וקרן ולקם · ראה עוד »

רצף ייחוס

ההדפסה הראשונה של רצף הייחוס האנושי מוצג כסדרת ספרים המוצגים באוסף ולקם, לונדון. סידרה זו מכילה מעל מאה כרכים באורך של אלפי עמודים, ובתוכם כ-3.4 מיליארד נוקליאוטידים, בגודל כתב קטן מאוד שכמעט בלתי ניתן לקריאה בעין בלתי מזוינת. רצף ייחוס או גנום ייחוס (באנגלית: Reference Genome או Reference Assembly) הוא מאגר דיגיטלי של רצף נוקליאוטידים, שמטרתו לייצג את הגנום של יצור מסוים.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ורצף ייחוס · ראה עוד »

ריצוף DNA

חלק מג'ל עם מקטעי DNA מסומנים דוגמאות לשימוש ב־4 צבעים פלואורסצנטיים לפי שיטת סנגר: מימין, דוגמה לשימוש בצבען מתייג על קצה הדידאוקסינוקליאוטיד. משמאל, הדמיה של שימוש בתיוג על התחל. ריצוף DNA (בעברית הַרְצָפָה) הוא תהליך של פענוח סדר הנוקלאוטידים בקטע DNA.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וריצוף DNA · ראה עוד »

טקסט

טקסט (מלטינית: Textum – במובן הפשוט "מארג" של מילים; בעברית: תמליל), הוא מונח שמקורו בתחום הבלשנות, המתאר רצף מילים, משפטים ופסקאות היוצרים יחד מכלול, שהוא הטקסט.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וטקסט · ראה עוד »

ביואינפורמטיקה

מפת כרומוזום X אנושי (מתוך אתר NCBI). מיפוי גנום האדם הוא אחד מהישגי הביואינפורמטיקה. ביואינפורמטיקה (באנגלית: Bioinformatics), (ביולוגיה חישובית) עוסקת בחקר המידע הביולוגי באמצעות מחשב.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וביואינפורמטיקה · ראה עוד »

דה פקטו

דֵּה פַקְטוֹ (בלטינית: De facto; בעברית: למעשה) הוא ביטוי לטיני שמשמעו "בפועל" או "למעשה".

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ ודה פקטו · ראה עוד »

כרוכית

כְּרוּכִית ("@") (בעברית מדוברת: שטרודל; באנגלית: "At" כשקוראים אותו או "At sign" כשמדברים עליו) הוא סימן כתב המצויר על ידי כתיבת האות a ומשיכת קצהּ הימני התחתון לעיגול כמעט שלם מסביבו נגד כיוון השעון.

חָדָשׁ!!: פורמט FASTQ וכרוכית · ראה עוד »

אזכור

[1] https://he.wikipedia.org/wiki/פורמט_FASTQ

יוֹצֵאנִכנָס
היי! אנחנו בפייסבוק עכשיו! »